Jogue como X - Salve 64 reféns/robôs para destravar X. Alternativamente, derrote 2 Chefes.

Jogue como Zero - Você destravará Zero a medida que você progrida com Axl.

Conclusão bônus - Complete com sucesso o jogo e escolha a opção "New Game+" para começar com seus chips prévios, X e a sua armadura.

Aparencia de X alternativo - Na tela de seleção de personagens, segure Select e escolha X para vê-lo com todas as suas armaduras.

Última Armadura de X - Ache as coisas grandes azuis para as partes da Última Armadura de X (como com os jogos prévios com nas séries). Os locais delas estão como segue:

Estágio "Lava": Procure isto abaixo na primeira fase do estágio.

Estágio "Airplane": Olhe dentro do labirinto como um quarto na segunda fase do estágio.

Estágio "Computer": Use os portais para alcançá-lo na segunda fase do estágio.

Estágio "Jungle": Após a área "spike", busque 2 pedra que gospe pedras, um em cima do outro. Use estas duas pedras para saltar para à esquerda para cima do topo da área em um ramo da árvore para conseguir a vagem azul que contém as botas.